Sea Shepherd fue fundado por el capitán Paul Watson en 1977. Desde entonces, se ha convertido en un movimiento mundial con entidades nacionales y regionales independientes en más de 20 países. Estos grupos están unidos por una misión común a través del Sea Shepherd Global con sede en Ámsterdam, establecido en 2013, que coordina las finanzas, las comunicaciones, la logística y una flota de cinco barcos para cooperar en campañas de conservación marina de acción directa en todo el mundo. Sea Shepherd Global es una organización sin fines de lucro registrada en los Países Bajos como "Stichting Sea Shepherd Global" liderada por el CEO, el Capitán Alex Cornelissen.